Merupakan program unggulan yang didedikasikan bagi peserta didik untuk menghafalkan Al- Qur’an dengan target hafal 3 juz tiap semester (18 juz dalam 3 tahun), namun tetap memiliki daya saing di bidang sains dan teknologi. Program Kelas Tahfizh:

1. Melaksanakan program kurikulum terpadu yang mengintegrasikan Pendidikan Al Qur’an dengan sains.

2. Pembelajaran sesuai kurikulum Program Sekolah Penggerak.

3. Pembelajaran Kajian Al Qur’an (KAQ) dalam segi makna dan implementasinya.

4. Program Tahsin (perbaikan baca Al Qur’an) secara intens pada bulan pertama.

5. Dibimbing oleh para hufadz yang telah memiliki syahadah dari Lembaga Tahfidz di UINMA dan Pondok Pesantren.

6. Melaksanakan setoran hafalan setiap bulan.

7. Pengujian hafalan tahfidz pada akhir semester.

8. Mendapatkan Sertifikasi Tahfidz setelah mengikuti pengujian hafalan pada akhir tahun ketiga.